Erkek genital sistemi hem iç hem de dış kısımlardan oluşur. Dış erkek cinsel organı arasında penis, üretra ve skrotum bulunur. İç erkek cinsel organları arasında seminal vezikül, testisler, vas deferens, epididim, prostat, bulboüretral bez ve ejakülatuar kanal bulunur.
Penis, hem cinsel hem de bedensel işlevleri olan dış erkek cinsel organının ana parçasıdır. Seks sırasında spermi (sperm içeren) boşaltır ve vücuttaki idrarı rahatlatır. Üretra, idrarı mesaneden erkek vücudunun dışına taşır. Semen ayrıca üretradan geçer.
Her erkeğin, iç erkek cinsel organının (epididim, testisler ve alt spermatik kordlar) belirli kısımlarını barındıran iki skrotal kesesi vardır. Testisler, sperm üretip depoladıkları ve erkek vücuduna erkek özelliklerinin ve üreme organlarının gelişimini kontrol eden hormonlar sağladıkları için iç erkek cinsel organının en önemli parçasıdır.
Epididim, spermi testisler ve spermi üretraya yönlendiren vas deferens arasında depolar, olgunlaştırır ve taşır. Seminal veziküller üretraya bitişiktir ve nihayetinde ejakülatuar kanaldan boşaltılan süt gibi bir sıvı salgılar. Bulboüretral bezler ayrıca meninin boşaltılmasına yardımcı olur.
